Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNGR4O95473 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms