Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB5O95377 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB5O95377 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB5O95377 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB5O95377 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB5O95377 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB5O95377 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB5O95377 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB5O95377 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB5O95377 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB5O95377 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB5O95377 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB5O95377 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB5O95377 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB5O95377 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB5O95377 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB5O95377 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB5O95377 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB5O95377 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB5O95377 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB5O95377 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB5O95377 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB5O95377 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB5O95377 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB5O95377 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB5O95377 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB5O95377 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB5O95377 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB5O95377 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB5O95377 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB5O95377 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB5O95377 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB5O95377 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB5O95377 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB5O95377 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB5O95377 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB5O95377 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB5O95377 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB5O95377 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB5O95377 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB5O95377 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB5O95377 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB5O95377 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB5O95377 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB5O95377 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB5O95377 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB5O95377 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB5O95377 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB5O95377 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB5O95377 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB5O95377 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB5O95377 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB5O95377 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB5O95377 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB5O95377 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB5O95377 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB5O95377 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB5O95377 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB5O95377 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB5O95377 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB5O95377 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB5O95377 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB5O95377 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB5O95377 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB5O95377 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB5O95377 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB5O95377 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB5O95377 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB5O95377 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB5O95377 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB5O95377 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB5O95377 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB5O95377 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB5O95377 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB5O95377 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB5O95377 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB5O95377 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB5O95377 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB5O95377 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB5O95377 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB5O95377 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB5O95377 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB5O95377 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB5O95377 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB5O95377 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB5O95377 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB5O95377 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB5O95377 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB5O95377 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB5O95377 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB5O95377 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB5O95377 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB5O95377 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB5O95377 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB5O95377 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB5O95377 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB5O95377 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB5O95377 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB5O95377 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB5O95377 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms