Protein–RNA interactions for Protein: O95274

LYPD3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD3O95274 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
LYPD3O95274 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LYPD3O95274 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYPD3O95274 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms