Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE8BO95263 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE8BO95263 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE8BO95263 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE8BO95263 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE8BO95263 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE8BO95263 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE8BO95263 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE8BO95263 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE8BO95263 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE8BO95263 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE8BO95263 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE8BO95263 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE8BO95263 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE8BO95263 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE8BO95263 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE8BO95263 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE8BO95263 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE8BO95263 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE8BO95263 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDE8BO95263 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDE8BO95263 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PDE8BO95263 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDE8BO95263 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDE8BO95263 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE8BO95263 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE8BO95263 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PDE8BO95263 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE8BO95263 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE8BO95263 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE8BO95263 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE8BO95263 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE8BO95263 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE8BO95263 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE8BO95263 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE8BO95263 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE8BO95263 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE8BO95263 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE8BO95263 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE8BO95263 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE8BO95263 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms