Protein–RNA interactions for Protein: O94967

WDR47, WD repeat-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR47O94967 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR47O94967 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR47O94967 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR47O94967 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR47O94967 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR47O94967 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR47O94967 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR47O94967 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR47O94967 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR47O94967 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR47O94967 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR47O94967 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR47O94967 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR47O94967 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR47O94967 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR47O94967 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR47O94967 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR47O94967 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR47O94967 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR47O94967 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR47O94967 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR47O94967 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR47O94967 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR47O94967 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR47O94967 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR47O94967 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR47O94967 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR47O94967 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR47O94967 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR47O94967 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR47O94967 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR47O94967 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR47O94967 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR47O94967 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR47O94967 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR47O94967 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR47O94967 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR47O94967 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR47O94967 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR47O94967 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR47O94967 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR47O94967 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR47O94967 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR47O94967 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR47O94967 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR47O94967 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR47O94967 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR47O94967 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR47O94967 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
WDR47O94967 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
WDR47O94967 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR47O94967 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR47O94967 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR47O94967 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR47O94967 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR47O94967 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR47O94967 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR47O94967 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR47O94967 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR47O94967 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR47O94967 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR47O94967 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR47O94967 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR47O94967 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR47O94967 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR47O94967 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR47O94967 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR47O94967 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR47O94967 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR47O94967 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR47O94967 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR47O94967 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR47O94967 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR47O94967 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR47O94967 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR47O94967 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR47O94967 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR47O94967 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR47O94967 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR47O94967 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR47O94967 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR47O94967 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR47O94967 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR47O94967 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR47O94967 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR47O94967 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR47O94967 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR47O94967 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR47O94967 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR47O94967 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR47O94967 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR47O94967 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR47O94967 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR47O94967 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR47O94967 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR47O94967 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR47O94967 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR47O94967 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR47O94967 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR47O94967 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms