Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM63AO94886 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM63AO94886 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms