Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ECM2O94769 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ECM2O94769 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ECM2O94769 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM2O94769 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM2O94769 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM2O94769 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM2O94769 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM2O94769 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM2O94769 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ECM2O94769 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ECM2O94769 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ECM2O94769 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ECM2O94769 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ECM2O94769 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ECM2O94769 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ECM2O94769 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ECM2O94769 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ECM2O94769 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECM2O94769 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECM2O94769 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECM2O94769 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ECM2O94769 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECM2O94769 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECM2O94769 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECM2O94769 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ECM2O94769 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ECM2O94769 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ECM2O94769 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ECM2O94769 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ECM2O94769 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ECM2O94769 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ECM2O94769 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ECM2O94769 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ECM2O94769 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ECM2O94769 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ECM2O94769 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ECM2O94769 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ECM2O94769 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ECM2O94769 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ECM2O94769 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ECM2O94769 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ECM2O94769 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ECM2O94769 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ECM2O94769 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ECM2O94769 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ECM2O94769 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ECM2O94769 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ECM2O94769 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ECM2O94769 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ECM2O94769 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ECM2O94769 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ECM2O94769 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ECM2O94769 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ECM2O94769 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ECM2O94769 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ECM2O94769 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ECM2O94769 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ECM2O94769 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ECM2O94769 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ECM2O94769 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ECM2O94769 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ECM2O94769 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ECM2O94769 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ECM2O94769 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ECM2O94769 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ECM2O94769 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ECM2O94769 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ECM2O94769 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECM2O94769 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECM2O94769 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECM2O94769 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECM2O94769 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECM2O94769 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECM2O94769 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ECM2O94769 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECM2O94769 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ECM2O94769 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECM2O94769 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECM2O94769 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ECM2O94769 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ECM2O94769 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ECM2O94769 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ECM2O94769 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ECM2O94769 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ECM2O94769 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ECM2O94769 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ECM2O94769 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ECM2O94769 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ECM2O94769 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ECM2O94769 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ECM2O94769 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ECM2O94769 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ECM2O94769 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ECM2O94769 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ECM2O94769 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ECM2O94769 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ECM2O94769 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ECM2O94769 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ECM2O94769 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms