Protein–RNA interactions for Protein: O75956

CDK2AP2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2AP2O75956 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK2AP2O75956 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms