Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB3O75712 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB3O75712 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB3O75712 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB3O75712 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB3O75712 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB3O75712 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB3O75712 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB3O75712 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB3O75712 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB3O75712 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB3O75712 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB3O75712 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB3O75712 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB3O75712 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB3O75712 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB3O75712 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB3O75712 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB3O75712 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB3O75712 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB3O75712 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB3O75712 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB3O75712 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB3O75712 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB3O75712 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB3O75712 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB3O75712 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB3O75712 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB3O75712 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB3O75712 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB3O75712 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB3O75712 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB3O75712 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB3O75712 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB3O75712 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB3O75712 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB3O75712 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB3O75712 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB3O75712 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB3O75712 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB3O75712 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB3O75712 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB3O75712 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB3O75712 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB3O75712 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB3O75712 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB3O75712 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB3O75712 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB3O75712 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB3O75712 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GJB3O75712 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB3O75712 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB3O75712 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB3O75712 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB3O75712 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB3O75712 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB3O75712 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB3O75712 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB3O75712 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB3O75712 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB3O75712 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB3O75712 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB3O75712 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB3O75712 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB3O75712 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB3O75712 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB3O75712 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB3O75712 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB3O75712 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB3O75712 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB3O75712 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB3O75712 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB3O75712 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB3O75712 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB3O75712 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB3O75712 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB3O75712 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB3O75712 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB3O75712 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB3O75712 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB3O75712 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB3O75712 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB3O75712 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB3O75712 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB3O75712 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB3O75712 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB3O75712 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB3O75712 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB3O75712 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB3O75712 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB3O75712 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB3O75712 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB3O75712 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB3O75712 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB3O75712 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB3O75712 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB3O75712 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB3O75712 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB3O75712 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB3O75712 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms