Protein–RNA interactions for Protein: O75449

KATNA1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNA1O75449 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
KATNA1O75449 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KATNA1O75449 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KATNA1O75449 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms