Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22BO75396 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms