Protein–RNA interactions for Protein: O75132

ZBED4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4O75132 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZBED4O75132 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED4O75132 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms