Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF3O75054 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms