Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSL4O60488 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms