Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCH6O60337 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARCH6O60337 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms