Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP104O60308 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP104O60308 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP104O60308 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP104O60308 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP104O60308 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP104O60308 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP104O60308 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP104O60308 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP104O60308 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP104O60308 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP104O60308 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP104O60308 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP104O60308 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP104O60308 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP104O60308 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP104O60308 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP104O60308 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP104O60308 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP104O60308 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP104O60308 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP104O60308 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP104O60308 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP104O60308 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP104O60308 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP104O60308 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP104O60308 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP104O60308 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP104O60308 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP104O60308 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP104O60308 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP104O60308 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP104O60308 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP104O60308 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP104O60308 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP104O60308 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP104O60308 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP104O60308 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP104O60308 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP104O60308 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP104O60308 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP104O60308 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP104O60308 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP104O60308 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP104O60308 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP104O60308 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP104O60308 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP104O60308 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP104O60308 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP104O60308 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP104O60308 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CEP104O60308 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CEP104O60308 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP104O60308 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP104O60308 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP104O60308 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP104O60308 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP104O60308 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP104O60308 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP104O60308 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP104O60308 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP104O60308 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP104O60308 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP104O60308 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP104O60308 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP104O60308 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP104O60308 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP104O60308 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP104O60308 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP104O60308 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP104O60308 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP104O60308 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP104O60308 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP104O60308 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP104O60308 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP104O60308 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP104O60308 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP104O60308 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP104O60308 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP104O60308 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP104O60308 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP104O60308 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP104O60308 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP104O60308 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP104O60308 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP104O60308 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP104O60308 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP104O60308 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP104O60308 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP104O60308 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP104O60308 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP104O60308 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP104O60308 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP104O60308 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP104O60308 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP104O60308 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP104O60308 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP104O60308 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP104O60308 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP104O60308 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms