Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOX15O60248 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOX15O60248 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOX15O60248 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOX15O60248 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOX15O60248 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOX15O60248 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SOX15O60248 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SOX15O60248 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOX15O60248 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOX15O60248 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOX15O60248 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOX15O60248 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOX15O60248 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOX15O60248 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SOX15O60248 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOX15O60248 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOX15O60248 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOX15O60248 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOX15O60248 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOX15O60248 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOX15O60248 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOX15O60248 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOX15O60248 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOX15O60248 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SOX15O60248 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOX15O60248 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOX15O60248 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOX15O60248 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOX15O60248 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOX15O60248 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOX15O60248 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOX15O60248 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOX15O60248 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOX15O60248 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOX15O60248 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOX15O60248 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOX15O60248 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SOX15O60248 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOX15O60248 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOX15O60248 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOX15O60248 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOX15O60248 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOX15O60248 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOX15O60248 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOX15O60248 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOX15O60248 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOX15O60248 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOX15O60248 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOX15O60248 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOX15O60248 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOX15O60248 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOX15O60248 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOX15O60248 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOX15O60248 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOX15O60248 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SOX15O60248 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOX15O60248 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOX15O60248 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOX15O60248 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOX15O60248 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOX15O60248 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOX15O60248 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOX15O60248 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOX15O60248 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOX15O60248 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOX15O60248 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOX15O60248 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOX15O60248 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOX15O60248 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOX15O60248 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOX15O60248 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOX15O60248 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOX15O60248 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOX15O60248 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOX15O60248 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOX15O60248 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOX15O60248 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOX15O60248 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SOX15O60248 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SOX15O60248 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SOX15O60248 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOX15O60248 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOX15O60248 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOX15O60248 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOX15O60248 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOX15O60248 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOX15O60248 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOX15O60248 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOX15O60248 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOX15O60248 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOX15O60248 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOX15O60248 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOX15O60248 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOX15O60248 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOX15O60248 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOX15O60248 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOX15O60248 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOX15O60248 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOX15O60248 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms