Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SLC25A20O43772 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms