Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATCO43716 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATCO43716 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATCO43716 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATCO43716 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATCO43716 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATCO43716 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATCO43716 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATCO43716 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATCO43716 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATCO43716 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATCO43716 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATCO43716 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATCO43716 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATCO43716 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATCO43716 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATCO43716 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GATCO43716 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATCO43716 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GATCO43716 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATCO43716 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATCO43716 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATCO43716 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATCO43716 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GATCO43716 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GATCO43716 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GATCO43716 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATCO43716 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATCO43716 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATCO43716 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATCO43716 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATCO43716 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATCO43716 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATCO43716 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATCO43716 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATCO43716 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATCO43716 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GATCO43716 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATCO43716 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATCO43716 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATCO43716 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATCO43716 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATCO43716 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATCO43716 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATCO43716 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATCO43716 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATCO43716 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATCO43716 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATCO43716 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATCO43716 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATCO43716 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATCO43716 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATCO43716 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATCO43716 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATCO43716 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GATCO43716 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATCO43716 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATCO43716 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATCO43716 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATCO43716 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATCO43716 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATCO43716 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATCO43716 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATCO43716 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GATCO43716 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATCO43716 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATCO43716 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATCO43716 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GATCO43716 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATCO43716 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATCO43716 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GATCO43716 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATCO43716 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATCO43716 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATCO43716 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATCO43716 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATCO43716 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATCO43716 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATCO43716 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATCO43716 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATCO43716 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATCO43716 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATCO43716 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATCO43716 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATCO43716 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GATCO43716 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATCO43716 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATCO43716 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATCO43716 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATCO43716 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATCO43716 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GATCO43716 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATCO43716 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATCO43716 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATCO43716 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATCO43716 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATCO43716 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATCO43716 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATCO43716 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATCO43716 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms