Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCXO43602 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCXO43602 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCXO43602 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCXO43602 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCXO43602 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCXO43602 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCXO43602 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCXO43602 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCXO43602 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCXO43602 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCXO43602 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCXO43602 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCXO43602 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCXO43602 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCXO43602 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCXO43602 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCXO43602 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCXO43602 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCXO43602 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCXO43602 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCXO43602 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCXO43602 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCXO43602 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCXO43602 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCXO43602 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCXO43602 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DCXO43602 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCXO43602 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCXO43602 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCXO43602 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCXO43602 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCXO43602 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCXO43602 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DCXO43602 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DCXO43602 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCXO43602 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCXO43602 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCXO43602 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCXO43602 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCXO43602 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCXO43602 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCXO43602 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCXO43602 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DCXO43602 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCXO43602 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCXO43602 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DCXO43602 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCXO43602 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCXO43602 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCXO43602 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCXO43602 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCXO43602 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCXO43602 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCXO43602 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCXO43602 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCXO43602 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCXO43602 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCXO43602 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCXO43602 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCXO43602 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCXO43602 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DCXO43602 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCXO43602 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCXO43602 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCXO43602 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCXO43602 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCXO43602 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCXO43602 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCXO43602 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DCXO43602 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCXO43602 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCXO43602 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCXO43602 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCXO43602 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCXO43602 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DCXO43602 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCXO43602 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCXO43602 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCXO43602 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCXO43602 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCXO43602 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCXO43602 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCXO43602 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCXO43602 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCXO43602 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCXO43602 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCXO43602 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCXO43602 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCXO43602 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCXO43602 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCXO43602 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCXO43602 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCXO43602 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCXO43602 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCXO43602 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCXO43602 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCXO43602 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCXO43602 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCXO43602 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms