Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF13O43567 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF13O43567 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF13O43567 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF13O43567 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF13O43567 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF13O43567 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF13O43567 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF13O43567 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF13O43567 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF13O43567 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RNF13O43567 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RNF13O43567 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RNF13O43567 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF13O43567 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF13O43567 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF13O43567 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF13O43567 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF13O43567 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF13O43567 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF13O43567 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF13O43567 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF13O43567 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF13O43567 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF13O43567 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF13O43567 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF13O43567 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF13O43567 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF13O43567 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF13O43567 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF13O43567 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF13O43567 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF13O43567 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF13O43567 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF13O43567 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF13O43567 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF13O43567 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF13O43567 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF13O43567 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF13O43567 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF13O43567 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF13O43567 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF13O43567 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF13O43567 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF13O43567 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF13O43567 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF13O43567 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF13O43567 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF13O43567 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF13O43567 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF13O43567 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF13O43567 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF13O43567 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF13O43567 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF13O43567 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF13O43567 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF13O43567 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF13O43567 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF13O43567 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF13O43567 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF13O43567 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF13O43567 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF13O43567 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF13O43567 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF13O43567 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF13O43567 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF13O43567 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF13O43567 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF13O43567 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF13O43567 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF13O43567 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF13O43567 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF13O43567 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF13O43567 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF13O43567 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNF13O43567 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF13O43567 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF13O43567 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF13O43567 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF13O43567 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF13O43567 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF13O43567 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF13O43567 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF13O43567 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF13O43567 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF13O43567 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF13O43567 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF13O43567 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF13O43567 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF13O43567 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF13O43567 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF13O43567 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF13O43567 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF13O43567 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF13O43567 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF13O43567 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF13O43567 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF13O43567 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF13O43567 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF13O43567 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms