Protein–RNA interactions for Protein: O43482

OIP5, Protein Mis18-beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OIP5O43482 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OIP5O43482 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OIP5O43482 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
OIP5O43482 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OIP5O43482 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OIP5O43482 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OIP5O43482 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OIP5O43482 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OIP5O43482 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OIP5O43482 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
OIP5O43482 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OIP5O43482 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OIP5O43482 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OIP5O43482 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OIP5O43482 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OIP5O43482 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OIP5O43482 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OIP5O43482 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OIP5O43482 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OIP5O43482 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OIP5O43482 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OIP5O43482 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OIP5O43482 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OIP5O43482 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OIP5O43482 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OIP5O43482 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
OIP5O43482 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OIP5O43482 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OIP5O43482 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OIP5O43482 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OIP5O43482 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OIP5O43482 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OIP5O43482 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OIP5O43482 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OIP5O43482 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OIP5O43482 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OIP5O43482 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OIP5O43482 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OIP5O43482 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OIP5O43482 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OIP5O43482 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OIP5O43482 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
OIP5O43482 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OIP5O43482 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OIP5O43482 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OIP5O43482 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
OIP5O43482 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OIP5O43482 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
OIP5O43482 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OIP5O43482 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OIP5O43482 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OIP5O43482 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OIP5O43482 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
OIP5O43482 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OIP5O43482 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OIP5O43482 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OIP5O43482 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OIP5O43482 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OIP5O43482 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OIP5O43482 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OIP5O43482 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OIP5O43482 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OIP5O43482 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OIP5O43482 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OIP5O43482 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
OIP5O43482 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OIP5O43482 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OIP5O43482 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OIP5O43482 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OIP5O43482 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OIP5O43482 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
OIP5O43482 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OIP5O43482 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OIP5O43482 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OIP5O43482 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OIP5O43482 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OIP5O43482 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
OIP5O43482 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
OIP5O43482 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OIP5O43482 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OIP5O43482 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OIP5O43482 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OIP5O43482 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OIP5O43482 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OIP5O43482 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OIP5O43482 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OIP5O43482 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OIP5O43482 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OIP5O43482 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OIP5O43482 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OIP5O43482 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
OIP5O43482 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.3■■□□□ 1
OIP5O43482 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OIP5O43482 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OIP5O43482 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OIP5O43482 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OIP5O43482 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OIP5O43482 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OIP5O43482 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OIP5O43482 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms