Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ERI3O43414 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERI3O43414 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ERI3O43414 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERI3O43414 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERI3O43414 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERI3O43414 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERI3O43414 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERI3O43414 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERI3O43414 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERI3O43414 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERI3O43414 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERI3O43414 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERI3O43414 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERI3O43414 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERI3O43414 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERI3O43414 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERI3O43414 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERI3O43414 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERI3O43414 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERI3O43414 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERI3O43414 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERI3O43414 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERI3O43414 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERI3O43414 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERI3O43414 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERI3O43414 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERI3O43414 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERI3O43414 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERI3O43414 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERI3O43414 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERI3O43414 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERI3O43414 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERI3O43414 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERI3O43414 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERI3O43414 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERI3O43414 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERI3O43414 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERI3O43414 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERI3O43414 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERI3O43414 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERI3O43414 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERI3O43414 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERI3O43414 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERI3O43414 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERI3O43414 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERI3O43414 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERI3O43414 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERI3O43414 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERI3O43414 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERI3O43414 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERI3O43414 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERI3O43414 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERI3O43414 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERI3O43414 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ERI3O43414 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERI3O43414 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERI3O43414 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERI3O43414 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERI3O43414 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERI3O43414 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERI3O43414 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERI3O43414 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERI3O43414 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERI3O43414 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERI3O43414 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERI3O43414 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERI3O43414 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERI3O43414 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERI3O43414 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ERI3O43414 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ERI3O43414 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERI3O43414 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ERI3O43414 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERI3O43414 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERI3O43414 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERI3O43414 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERI3O43414 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERI3O43414 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERI3O43414 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERI3O43414 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERI3O43414 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERI3O43414 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERI3O43414 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERI3O43414 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERI3O43414 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERI3O43414 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERI3O43414 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERI3O43414 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERI3O43414 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERI3O43414 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERI3O43414 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERI3O43414 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERI3O43414 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERI3O43414 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ERI3O43414 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERI3O43414 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERI3O43414 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERI3O43414 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERI3O43414 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms