Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA3O43365 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA3O43365 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA3O43365 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA3O43365 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA3O43365 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA3O43365 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA3O43365 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA3O43365 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA3O43365 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA3O43365 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA3O43365 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA3O43365 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA3O43365 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA3O43365 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA3O43365 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA3O43365 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA3O43365 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA3O43365 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA3O43365 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA3O43365 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA3O43365 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA3O43365 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA3O43365 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA3O43365 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA3O43365 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA3O43365 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA3O43365 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA3O43365 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA3O43365 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA3O43365 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA3O43365 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA3O43365 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA3O43365 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA3O43365 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA3O43365 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA3O43365 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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