Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHGDHO43175 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHGDHO43175 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHGDHO43175 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms