Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ARPC5O15511 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARPC5O15511 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms