Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PHOX2AO14813 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms