Protein–RNA interactions for Protein: O14562

UBFD1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBFD1O14562 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBFD1O14562 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBFD1O14562 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms