Protein–RNA interactions for Protein: O00743

PPP6C, Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6CO00743 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP6CO00743 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP6CO00743 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP6CO00743 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms