Protein–RNA interactions for Protein: O00574

CXCR6, C-X-C chemokine receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR6O00574 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCR6O00574 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCR6O00574 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCR6O00574 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCR6O00574 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR6O00574 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR6O00574 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR6O00574 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR6O00574 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR6O00574 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR6O00574 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR6O00574 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR6O00574 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCR6O00574 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CXCR6O00574 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CXCR6O00574 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCR6O00574 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCR6O00574 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms