Protein–RNA interactions for Protein: O00541

PES1, Pescadillo homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PES1O00541 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PES1O00541 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PES1O00541 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PES1O00541 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PES1O00541 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PES1O00541 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PES1O00541 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PES1O00541 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PES1O00541 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PES1O00541 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PES1O00541 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PES1O00541 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PES1O00541 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PES1O00541 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PES1O00541 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PES1O00541 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PES1O00541 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PES1O00541 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PES1O00541 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PES1O00541 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PES1O00541 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PES1O00541 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PES1O00541 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PES1O00541 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PES1O00541 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PES1O00541 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PES1O00541 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PES1O00541 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PES1O00541 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PES1O00541 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PES1O00541 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PES1O00541 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PES1O00541 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PES1O00541 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PES1O00541 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PES1O00541 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PES1O00541 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PES1O00541 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PES1O00541 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PES1O00541 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PES1O00541 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PES1O00541 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PES1O00541 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PES1O00541 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PES1O00541 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PES1O00541 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PES1O00541 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PES1O00541 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PES1O00541 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PES1O00541 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PES1O00541 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PES1O00541 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PES1O00541 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PES1O00541 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PES1O00541 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PES1O00541 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PES1O00541 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PES1O00541 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PES1O00541 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PES1O00541 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PES1O00541 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PES1O00541 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PES1O00541 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PES1O00541 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PES1O00541 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PES1O00541 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PES1O00541 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PES1O00541 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PES1O00541 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PES1O00541 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PES1O00541 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PES1O00541 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PES1O00541 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PES1O00541 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PES1O00541 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PES1O00541 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PES1O00541 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PES1O00541 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PES1O00541 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PES1O00541 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PES1O00541 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PES1O00541 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PES1O00541 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PES1O00541 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PES1O00541 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PES1O00541 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PES1O00541 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PES1O00541 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PES1O00541 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PES1O00541 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PES1O00541 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PES1O00541 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PES1O00541 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PES1O00541 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PES1O00541 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PES1O00541 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PES1O00541 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PES1O00541 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PES1O00541 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PES1O00541 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms