Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE2AO00408 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE2AO00408 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms