Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
AP3B1O00203 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B1O00203 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms