Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
H7C1W4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
H7C1W4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
H7C1W4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
H7C1W4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
H7C1W4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
H7C1W4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
H7C1W4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
H7C1W4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
H7C1W4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
H7C1W4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
H7C1W4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
H7C1W4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
H7C1W4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
H7C1W4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
H7C1W4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
H7C1W4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
H7C1W4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
H7C1W4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
H7C1W4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
H7C1W4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
H7C1W4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
H7C1W4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
H7C1W4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
H7C1W4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
H7C1W4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
H7C1W4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
H7C1W4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
H7C1W4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
H7C1W4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
H7C1W4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
H7C1W4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
H7C1W4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
H7C1W4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
H7C1W4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
H7C1W4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
H7C1W4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
H7C1W4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
H7C1W4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
H7C1W4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
H7C1W4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
H7C1W4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
H7C1W4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
H7C1W4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
H7C1W4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
H7C1W4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
H7C1W4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
H7C1W4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
H7C1W4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
H7C1W4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
H7C1W4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
H7C1W4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
H7C1W4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
H7C1W4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
H7C1W4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
H7C1W4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
H7C1W4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
H7C1W4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
H7C1W4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
H7C1W4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
H7C1W4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
H7C1W4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
H7C1W4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
H7C1W4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
H7C1W4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
H7C1W4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
H7C1W4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
H7C1W4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
H7C1W4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
H7C1W4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
H7C1W4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
H7C1W4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
H7C1W4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
H7C1W4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
H7C1W4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
H7C1W4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
H7C1W4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
H7C1W4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
H7C1W4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
H7C1W4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
H7C1W4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
H7C1W4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
H7C1W4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
H7C1W4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
H7C1W4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
H7C1W4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
H7C1W4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
H7C1W4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
H7C1W4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
H7C1W4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
H7C1W4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
H7C1W4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
H7C1W4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
H7C1W4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
H7C1W4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
H7C1W4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
H7C1W4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
H7C1W4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
H7C1W4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
H7C1W4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms