Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA8SH3BPF8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA8SH3BPF8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms