Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.18■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms