Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB6E9PJ23 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms