Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLDN25C9JDP6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN25C9JDP6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
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