Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C5orf58C9J3I9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf58C9J3I9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 434.2 ms