Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
B4E1Z4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
B4E1Z4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
B4E1Z4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
B4E1Z4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
B4E1Z4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
B4E1Z4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
B4E1Z4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
B4E1Z4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
B4E1Z4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
B4E1Z4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
B4E1Z4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
B4E1Z4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
B4E1Z4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
B4E1Z4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
B4E1Z4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
B4E1Z4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
B4E1Z4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
B4E1Z4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
B4E1Z4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
B4E1Z4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
B4E1Z4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
B4E1Z4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
B4E1Z4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
B4E1Z4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
B4E1Z4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
B4E1Z4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
B4E1Z4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
B4E1Z4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
B4E1Z4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
B4E1Z4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
B4E1Z4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
B4E1Z4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
B4E1Z4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
B4E1Z4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
B4E1Z4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
B4E1Z4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
B4E1Z4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
B4E1Z4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
B4E1Z4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
B4E1Z4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.56■■■□□ 2
B4E1Z4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
B4E1Z4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
B4E1Z4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
B4E1Z4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
B4E1Z4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
B4E1Z4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
B4E1Z4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
B4E1Z4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
B4E1Z4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
B4E1Z4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
B4E1Z4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.54■■■□□ 2
B4E1Z4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
B4E1Z4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
B4E1Z4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
B4E1Z4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
B4E1Z4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
B4E1Z4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
B4E1Z4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
B4E1Z4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
B4E1Z4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
B4E1Z4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
B4E1Z4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
B4E1Z4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
B4E1Z4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
B4E1Z4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
B4E1Z4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
B4E1Z4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
B4E1Z4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
B4E1Z4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
B4E1Z4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
B4E1Z4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
B4E1Z4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
B4E1Z4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
B4E1Z4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
B4E1Z4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
B4E1Z4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
B4E1Z4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
B4E1Z4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
B4E1Z4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
B4E1Z4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
B4E1Z4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
B4E1Z4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
B4E1Z4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
B4E1Z4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
B4E1Z4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
B4E1Z4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
B4E1Z4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
B4E1Z4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
B4E1Z4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
B4E1Z4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
B4E1Z4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
B4E1Z4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
B4E1Z4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
B4E1Z4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
B4E1Z4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
B4E1Z4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
B4E1Z4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
B4E1Z4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
B4E1Z4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms