Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf47A7E2U8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4orf47A7E2U8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4orf47A7E2U8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms