Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KNCNA6PVL3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KNCNA6PVL3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KNCNA6PVL3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms