Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A6NNZ2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A6NNZ2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A6NNZ2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A6NNZ2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A6NNZ2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A6NNZ2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A6NNZ2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A6NNZ2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A6NNZ2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A6NNZ2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A6NNZ2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A6NNZ2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A6NNZ2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A6NNZ2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
A6NNZ2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
A6NNZ2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A6NNZ2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A6NNZ2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A6NNZ2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A6NNZ2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A6NNZ2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A6NNZ2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A6NNZ2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A6NNZ2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A6NNZ2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A6NNZ2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A6NNZ2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A6NNZ2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A6NNZ2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A6NNZ2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A6NNZ2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A6NNZ2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A6NNZ2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A6NNZ2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A6NNZ2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A6NNZ2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A6NNZ2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A6NNZ2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A6NNZ2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A6NNZ2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A6NNZ2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A6NNZ2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A6NNZ2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A6NNZ2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A6NNZ2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A6NNZ2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A6NNZ2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A6NNZ2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A6NNZ2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A6NNZ2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A6NNZ2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A6NNZ2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A6NNZ2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A6NNZ2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A6NNZ2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A6NNZ2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A6NNZ2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
A6NNZ2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A6NNZ2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A6NNZ2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
A6NNZ2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
A6NNZ2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A6NNZ2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A6NNZ2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A6NNZ2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A6NNZ2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A6NNZ2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A6NNZ2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A6NNZ2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A6NNZ2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
A6NNZ2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
A6NNZ2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A6NNZ2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A6NNZ2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A6NNZ2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
A6NNZ2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A6NNZ2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A6NNZ2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A6NNZ2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A6NNZ2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A6NNZ2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A6NNZ2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A6NNZ2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A6NNZ2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A6NNZ2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A6NNZ2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A6NNZ2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A6NNZ2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A6NNZ2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A6NNZ2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A6NNZ2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A6NNZ2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A6NNZ2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
A6NNZ2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
A6NNZ2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A6NNZ2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A6NNZ2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A6NNZ2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A6NNZ2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms