Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMD3A2A2Y4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FRMD3A2A2Y4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms