Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S1A1TA0A578 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCRBV5S1A1TA0A578 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCRBV5S1A1TA0A578 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCRBV5S1A1TA0A578 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCRBV5S1A1TA0A578 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCRBV5S1A1TA0A578 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCRBV5S1A1TA0A578 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCRBV5S1A1TA0A578 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCRBV5S1A1TA0A578 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCRBV5S1A1TA0A578 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCRBV5S1A1TA0A578 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCRBV5S1A1TA0A578 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCRBV5S1A1TA0A578 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCRBV5S1A1TA0A578 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCRBV5S1A1TA0A578 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCRBV5S1A1TA0A578 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCRBV5S1A1TA0A578 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCRBV5S1A1TA0A578 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TCRBV5S1A1TA0A578 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TCRBV5S1A1TA0A578 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCRBV5S1A1TA0A578 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCRBV5S1A1TA0A578 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCRBV5S1A1TA0A578 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCRBV5S1A1TA0A578 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCRBV5S1A1TA0A578 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms