Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVM2

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVM2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A1B0GVM2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A1B0GVM2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A1B0GVM2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A1B0GVM2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A1B0GVM2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A1B0GVM2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A1B0GVM2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A1B0GVM2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A1B0GVM2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A1B0GVM2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A1B0GVM2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A1B0GVM2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A1B0GVM2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A1B0GVM2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A1B0GVM2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A1B0GVM2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
A0A1B0GVM2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A1B0GVM2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms