Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXV3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms