Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUJ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUJ7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A0A087WUJ7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
A0A087WUJ7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
A0A087WUJ7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
A0A087WUJ7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A0A087WUJ7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A0A087WUJ7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
A0A087WUJ7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A0A087WUJ7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
A0A087WUJ7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms