Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AFG3L2Q9Y4W6 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms