Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CPNE7Q9UBL6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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